火影忍者轮回眼的启动方式核心有三种，分别是因陀罗与阿修罗查克拉融合觉醒、六道仙人直接力量馈赠、吞食神树果实或移植轮回眼，其中忍者阵营主流启动方式为前两种，需满足特定瞳术基础与查克拉条件才能触发。
作为写轮眼的终极进化形态，轮回眼启动的基础前提是拥有永恒万花筒写轮眼，普通写轮眼与万花筒写轮眼无法承载轮回眼的庞大瞳力，只有移植至亲的万花筒写轮眼进化为永恒万花筒后，才能成为轮回眼的适配容器。满足瞳术基础后，核心启动条件是因陀罗与阿修罗查克拉的融合，因陀罗转世者（宇智波一族）移植阿修罗转世者（千手一族）的细胞，让代表阴之力的瞳力与代表阳之力的生命力交汇，重新合成六道仙人查克拉，经过长期查克拉积累与身体适应，便可触发轮回眼觉醒，宇智波斑便是在终末谷之战获得千手柱间细胞后，历经漫长岁月在濒死之际成功开启轮回眼。
第二种启动方式是接受六道仙人的直接力量馈赠，无需漫长的查克拉融合过程，在濒死状态下获得六道仙人赋予的阴之力或阳之力，与体内已有的对应查克拉产生强烈催化反应，可瞬间启动轮回眼。宇智波佐助在第四次忍界大战中被斑重伤，体内植入柱间细胞后，于意识世界接受六道仙人的阴之力馈赠，左眼直接进化为六勾玉轮回眼，这种方式能跳过常规觉醒的漫长周期，在战斗关键时刻快速获得轮回眼力量。
第三种启动方式属于大筒木一族特殊途径，一是吞食神树果实，神树果实凝聚海量查克拉精华，吞食后可直接觉醒轮回写轮眼，衍生出轮回眼力量，大筒木辉夜便是独吞神树果实后额头开启轮回写轮眼；二是直接移植已激活的轮回眼，将他人成熟的轮回眼移植至自身，虽会产生查克拉排异反应，但能快速获得轮回眼能力，宇智波带土移植长门的轮回眼后，便可操控外道魔像与施展六道之术，是最直接的启动方式，但无法发挥轮回眼的全部专属潜能。
启动轮回眼后，玩家可操控全套六道之术，涵盖天道、人间道、修罗道、畜生道、饿鬼道、地狱道能力，兼具攻击、防御、感知、吸收、通灵等全能效果，还能使用外道·轮回天生之术等禁术，不同轮回眼拥有专属瞳术，如佐助的天手力、斑的轮墓·边狱。实战中需合理控制查克拉消耗，轮回眼瞳术威力极强但查克拉损耗巨大，持续使用易导致身体透支，搭配六道仙术使用可降低负担，同时利用轮回眼的空间与引力能力掌控战场节奏，搭配通灵术与封印术形成完整战斗体系，最大化轮回眼的实战价值。
